洪武年间，水亭村东面小溪上筑有一亭，名水亭，后即以亭命名其村。
2022年10月，2022年淘宝村名单发布，水亭村上榜。
2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝村名单，水亭村榜上有名。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝村，水亭村榜上有名。
水亭村是平阳县昆阳镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为330326100268，居民身份证号码前6位为330326。邮政编码为325400，长途电话区号为577 ，车牌号码为浙C。水亭村与步廊村、湖屿村、长山村、建丰村、庙头村、民丰村、郭庄村、上林垟村、临区村、石塘村、龙安村、垟港村、鸣山村、万金村相邻。历史沿革：解放初为鸣山乡水亭村，不久划归水亭乡。
1956年属石塘乡第一高级社。
1958年属钢城公社，翌年春并入万全公社，属水亭大队（管理区）。
1961年为水亭公社水亭大队。
1984年称水亭村委会，属水亭乡。
2000年随水亭乡并入昆阳镇。
