因干渠南面有一个小土墩子，村子范围大概三里而得名。
2021年12月，三里墩村被命名为2021年度淮安市卫生村。
三里墩村：位于宋集乡东南5公里处。三里墩村与大董庄村、青莲岗村、后营村、甘姜村、条沿村、园艺场村、冯王村、谷尹村、高陈村、李码村、宋集村、五里村、镇西村、韩赵村相邻。历史沿革：解放初期，叫三里墩，公社时期改为三里墩大队，1983年上级批准设立三里墩村村民委员会，沿用至今。
