因石墩港、旺墩上两个自然村东临澄湖，取澄、墩两字组合定名为“澄墩”。

澄墩村：东临澄湖，西靠苏同黎，全村总人口2699人，总户数739户，有32个村民小组，13个自然村。澄墩村与长巨村、湖浜村、三马村、瑶盛村、前港村、江湾村、甫田村、甫港村、甫南村、澄东村、澄湖村、澄北村、淞浦村、淞港村相邻。荣誉排行：

2025年8月，东街上上榜第八批江苏省传统村落名单。

2023年3月，澄墩村东街上自然村被确定为第二批苏州市传统村落。

澄湖遗址澄湖遗址，在吴县车坊乡澄墩村和大姚村，范围十分广袤，部分淹没在湖底，部分遗存在滨湖农田之下，面积约有2～3平方公里。1974年南京博物院和吴县文化馆发掘古井150余口，出土并征集了新石器时代历史沿革：1969年，为车坊人民公社光明大队。

1981年，由光明大队改为澄墩大队。

1983年，澄墩大队改为澄墩村村委会。

2001年9月，撤销大姚村、澄墩村2个村委会，合并设立澄湖村村委会。

2004年2月，随车坊镇并属甪直镇。

2006年10月，复名为澄墩村村委会。