清朝同治年间，山东曹州人余氏在此建村，取名余庄。

余庄村：位于五段镇西南6公里处。下辖余庄1个自然村，现有558户，1651人，其中党员人数63人，耕地面积2099亩。主要产业为稻麦种植。现有幼儿园1家，卫生室1个，文体活动场地1个，镇村公交线路1条，村镇道路1条，垃圾收集3处，路灯25盏，公共厕所1处，河道整洁1处，绿化1处，综治中心1处，防灾避难场所1处，便民服务中心1处，村务公开栏1处，便民超市1家。余庄村与姜庄村、龙塘村、许口村、彭窑村、高庄村、孟庙村、张庄村、七段村、后六段村、前六段村、前四段村、四段村、三段村、后五段社区相邻。荣誉排行：

2020年12月，余庄村入选2020年度江苏省卫生镇（村）名单。

历史沿革：1975年，设余庄大队，属五段公社。

1983年，设立余庄村村民委员会，属五段乡。

1996年，撤乡设镇，隶属五段镇。