以境内的百子亭（老地名）得名。

百子亭社区地处美丽的玄武湖畔，东靠明城墙，西连中央路，北到玄武门路。2006年，由昆仑路社区、百子亭社区、高楼门社区部分合并而成。占地约0.23平方公里，现有常住居民2558户，7236人。 社区地理位置优越，交通便利，商业繁荣，环境优美。辖区内有江苏省肿瘤医院、玄武门社区卫生服务中心，以及江苏省新华集团公司、江苏省首家中国/WHO健康促进金奖学校——南京市中央路小学、南京军区司令部第三干休所和南空昆仑路干休所。社区内共有民国建筑17处、屋顶花园2处，创意休闲街区——明城汇坐落在社区内。 多年来，百子亭社区不断强化社区居民自我管理、自我教育、自我服务的民主意+查看详细百子亭社区概况>>

2020年12月，江苏省司法厅命名百子亭社区为江苏省第十四批省级“民主法治示范”村（社区）。

中央路84号民国建筑中央路84号民国建筑位于玄武区玄武门街道百子亭社区中央路84号，年代为民国。中央路84号民国建筑为不可移动文物。中央路82号民国建筑中央路82号民国建筑位于玄武区玄武门街道百子亭社区中央路82号，年代为民国。中央路82号民国建筑为不可移动文物。中央路52-1号民国建筑中央路52-1号民国建筑位于玄武区玄武门街道百子亭社区中央路52号之一，年代为民国。中央路52-1号民国建筑为不可移动文物。傅厚岗16号民国建筑傅厚岗16号民国建筑位于玄武区玄武门街道百子亭社区傅厚岗16号，年代为民国。傅厚岗16号民国建筑为不可移动文物。傅厚岗14号民国建筑傅厚岗14号民国建筑位于玄武区玄武门街道百子亭社区傅厚岗14号，年代为民国。傅厚岗14号民国建筑为不可移动文物。+查看更多百子亭社区文化旅游景点>>

历史沿革：1955年8月成立，名百子亭居民委员会。

2003年更名为百子亭社区居委会。

2006年昆仑路居委会并入，名称不变，沿用至今。