早先居民为侯村申氏，故名申沟，后又因村南有沟，又改为深沟。
深沟村是洪洞县兴唐寺乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为141024201214，居民身份证号码前6位为141024。邮政编码为041000，长途电话区号为357 ，车牌号码为晋L。深沟村与涧头村、孙家山村、王村村、关口村、兴唐寺村、杏沟村、桥东村、兰家沟村、苑川村相邻。历史沿革：1987年，成立第一届深沟村民委员会。
2001年，对行政区划作了调整：苑川乡改为兴唐寺乡。
深沟村民委员会归兴唐寺乡管辖。
2019年行政村合并，旱垣村并入深沟村民委员会，属兴唐寺乡管辖至今。
