立村时间约洪武年间，至今600多年，因吃水难搬到沟里，叫成南沟。世代繁衍分散居住，沟底的叫下南沟，山上的叫上南沟。上南沟村居民依法选举产生的基层群众自治组织。因村委会驻“上南沟”而得名。

2020年8月，山西省爱国卫生运动委员会命名上南沟村为2020—2022周期山西省卫生村。

上南沟村是河曲县楼子营镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140930101211，居民身份证号码前6位为140930。邮政编码为034000，长途电话区号为350 ，车牌号码为晋H。上南沟村与吴峪村、柏鹿泉村、大塔村、天洼村、梁家碛村、马连口村、大峪村、罗圈堡村、娘娘滩村、河湾村、楼子营村相邻。历史沿革：明洪武年间叫南沟村，世代繁衍开始分散居住，住沟底的叫下南沟，住山上的叫上南沟，1953年—1955年成立初级社，1956-1957年转为高级社，1958年人民公社成立南沟生产大队，1976年分两个自然村为两个生产大队，后分为两个行政村，即上南沟和下南沟村。

1984年成立上南沟村民委员会，并一直沿用至今。

2019年9月下南沟、白洼、柏树条、大榆岭村委会并入管辖。