该村位于普觉寺之北，村较大，起名小南头，与大北头对应，现为村民委员会驻地，故名。

2023年11月，山西省爱国卫生运动委员会命名小南头村为2023-2025年山西省卫生村。

2020年8月，山西省爱国卫生运动委员会命名小南头村为2020—2022周期山西省卫生村。

小南头村是应县杏寨乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140622204202，居民身份证号码前6位为140622。邮政编码为046000，长途电话区号为355 ，车牌号码为晋D。小南头村与赤堡村、望岩村、大西头村、杏寨村、大北头村、辛坊村、下甘港村、河疃村、冯庄村、安营村、旧堡村、石店村、大刘庄村、南湛村相邻。历史沿革：1948-1953年属应县八区；1954年成立小南头农业生产合作社；1956-1957年转为小南头高级农业合作社；1958年改农业合作社为小南头管理委员会，属杏寨公社；1967年成立小南头革命委员会；1976-1984年为杏寨人民公社小南头生产大队；1985年到至今为小南头村民委员会，属杏寨乡。