该村曾是姓李的一个庄子，人们定居在这里就称作李庄，因该地北面还有一个李庄，相对的就叫南李庄。

2020年8月，山西省爱国卫生运动委员会命名南李庄村为2020—2022周期山西省卫生村。

南李庄村是山阴县马营庄乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140621209222，居民身份证号码前6位为140621。邮政编码为036000，长途电话区号为349 ，车牌号码为晋F。南李庄村与故驿村、胡峪口村、南辛寨村、高庄村、南口前村、东沙堆村、西安峪村、新马营村、何庄村、大柴棚村、荆家庄村、吴家铺村、沙家寺村、云水庄村相邻。历史沿革：解放初，属山阴县第二区所辖；1953年，撤区建乡，由故驿乡所辖；1958年，撤乡建社，属山阴城人民公社所辖；1961年，属马营庄人民公社所辖；1984年7月17日，政社分设，属马营庄乡所辖，名称沿用至今。