相传该村原以吴马两姓为主。在1976年农田基本建设中，挖掘出一个古墓，发现一块砖上面写着吴某的名字，由此证明该村以吴、马两姓起名。

2021年1月，山西省民政厅确定吴马营村为2020年度山西省善治示范村。

吴马营村是山阴县吴马营乡下辖的行政村，城乡分类代码为210，为乡中心区。区划代码为140621200200，居民身份证号码前6位为140621。邮政编码为046000，长途电话区号为355 ，车牌号码为晋D。吴马营村与屯港村、东短川村、大坪村、南屯村、阎家窑村、马家河村、前榆林村、黄草梁村、后榆林村、包家岭村、西短川村相邻。历史沿革：解放初，属右玉县第五区史家屯乡所辖；1953年3月撤区设乡，属右玉县第五区前榆林乡所辖，5月以后，属山阴县西短川乡所辖；1958年人民公社化时，属山阴县玉井高峰人民公社所辖；1959年7月，属吴马营人民公社吴马营管理区吴马营大队；1984年7月17日撤社设乡，大队改村民委员会，成立吴马营村民委员会，属吴马营乡政府所辖。

2020年，吴马营乡尖山村，大洼村，两村并入吴马营村，属吴马营村委会所辖，名称沿+查看详细吴马营村历史沿革>>