据传：本村始建于明朝永乐年间。冀鲁大道从此通过，一农户在此开店。有一年运河决口，店房被冲毁，仅存半壁，遂取名为半壁店村。1949年改名为店子村，后分为两村，本村根据方位称店子南村。
冯家口镇店南村，位于冯家口镇东南部，全村共有486户，1876人，党员34名，耕地4000亩。店南是一个以工农生产结合的村，村民农业主要以种植小麦、玉米为主。店南村现有法人单位13家，个体户40家，主要以生产电子五金配件为主。近几年通过历任村“两委”班子的努力先后打机井10眼，解决出行难、浇地难、供电难的突出问题，保证农业年年丰收。店南村现有党员活动室3间，建筑面积120平方米，室内设备齐全，定期组织村务活动。店南村与西代庄村、店子辛村、大树金村、店北村、大道邢村、大王庄村、常庄村、东林子村、崔家洼村、冯家口村、陈辛村、谷庄村、柴庄子村、小王庄村相邻。荣誉排行：
2022年6月，被授予南皮县2020-2021年度县级文明村镇称号。
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