杨店镇因杨店镇镇政府驻杨店村而得名。
两当县辖乡。1949年设杨店乡，1958年并入西坡公社，为西坡公社驻地，1962年分设杨店公社，1983年复设乡。位于县境东部，红崖河两岸，距县城20公里。面积61平方公里，人口0.5万。316国道穿境。辖杨店、石马坪、土峰沟、夏家庄、豆坪、郁家庄、灵官殿、颜家河8个村委会。古为故道镇。境内有软木厂及国有林场。农业主产小麦、玉米、豆类，兼产苹果、核桃、毛竹、木材等。境内有张果老洞遗址。荣誉排行：
2023年3月，杨店镇被授予甘肃省第十六批省级文明村镇称号。
杨店古建筑群杨店古建筑群位于陇南市两当县杨店镇，主要由明清时期修建的何家作坊、米店、药房、银匠铺、车马店、余圣宫、福兴客栈等17处古建筑组成，分布在杨店全长700多米的主街道两侧。杨店古建筑群保存完整、历史沿革：汉唐时，为故道县所在地。
民国元年（1912年）后，改设团保制，为下红崖寺堡。
1934年，改区村制为保甲制，为故道镇所辖。
1958年，成立公杜时，为西坡公社所辖。
1962年1月，恢复两当县后，设立杨店公社。
1983年12月，改为杨店乡。
2016年6月，杨店乡撤乡设镇。
