咸丰年间已经成集市，因大量种植与经营中药材甘草，又是西安通住兰州的重要驿站，开设多处车马店、旅店、饭店，故名为甘草店镇。
甘草店镇位于榆中县东南部，地处苑川河中游，距县城25公里。北靠韦营乡，南连高崖镇，西依清水驿乡，东邻定西安定区。东西长约16公里，南北宽约15.6公里，总面积121.48平方公里。全镇辖13个行政村84个村民小组。甘草店镇，是历史上甘肃中部的重要交通枢纽，是连接甘、陕、川、青的“旱码头”，也是丝绸之路的必经之路。据史料记载，甘草店在旧石器时代就有先民居住，上古时为羌、戌住地。汉武帝元朔二年（前127年），属榆中县。据西北师大历史系教授陈守忠考证：十六时国西秦乞伏国仁所筑勇士城及后来的子城都在甘草店。清咸丰年间（公元1851年—1861年）甘草店已有集市，由于该地盛产中药甘草，陕西药商经常云集此+查看详细甘草店镇概况>>
2024年3月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名甘草店镇为2023年度甘肃省卫生乡镇（街道）。
2023年3月，甘草店镇被授予甘肃省第十六批省级文明村镇称号。
历史沿革：民国元年（1912年），设甘草店镇。
1955年9月，撤区并乡降为甘草店乡。
1958年，为高崖公社甘草店大队。
1961年，析出建甘草店公社。
