因清道光元年（1821年），此地修一泥瓦顶庙宇而得名。

瓦庙镇位于紫阳县西部偏南，米仓山中，东邻高滩镇，南壤毛坝镇，西、北两面与镇巴县观音、田坝、白河乡镇交界。总面积85.48平方公里，地形南北长，东西窄，东西宽10公里，南北长25公里，属北亚热带季风湿润气候，境内海拔450~1800米。镇政府驻地瓦庙子自然镇。全镇辖九个村一个居委会，总人口3445户，14156人。 改革开放以来，全镇的经济和社会事业有较大发展，工农业总产值达到2098万元，粮食总产达5600吨，农民人均纯收入1543元。以玉米、水稻、洋芋为主的粮食生产；以蚕桑、养羊、黄姜、魔芋、中药材、家庭养殖为主的多种经营生产；以板石、毒重石、煤炭、水电开采开发为主的乡镇企业；以劳+查看详细瓦庙镇概况>>

2021年5月，根据第七次全国人口普查结果，瓦庙镇人口数量为1.09万人，位列紫阳县各镇人口数量排行榜第11位。

2019年12月，陕西省爱国卫生运动委员会命名瓦庙镇为2019年度陕西省省级卫生乡镇。

历史沿革：1949年后，分属搪瓷、瓦庙、泥垭3个乡。

1996年，与保坪乡合并为瓦庙镇。