因地处大巴山，镇址在原巴山区公所所在地，故名巴山镇。

巴山镇位于川陕交界地带，距县城38公里，全镇总103.26平方公里。辖12个村，75个村民小组，2982户，10771人。有耕地1724亩，其中小水田，旱地15281亩。 近年来，镇党委、镇政府在“-”重要思想指引下，紧抓西部开发历史机遇，按照“围绕中心抓重点抓好重点促发展”的工件思路。立足镇情抓结构调整，突出特色项目，退耕还林，抓经济发展，突出招商引资抓产业化开发。目前，已发展中药材2340余亩，奶花芸豆12600亩，干果园1000余亩，百万元以上投资项目2个，2003年全镇实现工农业总产值2559万元，财政税收67万元，人均纯收入1006元，经济发展和各项社会事业取得可喜成绩。镇+查看详细巴山镇概况>>

2022年2月，巴山镇被推荐为陕西省第二批全省乡村治理示范村镇。

2018年12月，陕西省爱国卫生运动委员会命名巴山镇为2018年度陕西省省级卫生乡镇。

民国二十四年（1935年），红军在茅坪沟建立苏维埃乡政府。

民国三十三年（1944年），设天台乡（乡址关口坝），辖茅坪沟保。

1958年，改为公社下属管理区。

1984年4月，改为茅坪沟乡。

1996年5月，撤销巴山区，茅坪沟乡驻地迁原区公所办公处。

2001年，将关口坝乡并入，设立巴山镇。