木瓜镇因境内有古木瓜树面得名。

木瓜镇位于川黔交界处，北距重庆市270公里，南距桐梓县城80公里，境内山高、坡陡、谷深，土薄、水少、植被差，自然生存条件恶劣，经济发展水平较低。全镇总面积170.78平方公里，共辖13个行政村，95个村民组，总户数6395户，总人口为28808人，其中农业人口28727人。耕地面积20528亩，其中田6929亩，土13699亩。境内具有丰富的煤炭资源和旅游资源。共有煤矿10家，是全县产煤大镇之一。-河风景区景色优美，是休闲避暑的绝佳场所，近几年到此游览的重庆市客人络绎不绝。

水银河大峡谷旅游景区水银河位于贵州的大山深处，辖于木瓜镇-村，因河水清澈透亮，日光照射河面，银光点点而得名。-河之美用冰清玉洁、美似璞玉来形容最恰当不过了，虬枝险潭、垂帘瀑洞，原生态的景观令所至之人感叹不已。峡历史沿革：明万历二十九年（1601年）至清后期，属委化里。

清光绪年间（1875—1908年），属夜郎里。

1992年7月，木瓜、水银、白露（部分）3乡合并为木瓜镇。