因境内马祖寺，故名，马祖寺，明万历年间开建，清乾隆年间重建，意在纪念唐代佛教禅宗第八代祖师马道一。
马祖镇，旧名两路口、兴隆场，位于中国成都平原西北部，隶属什邡市。1950年建乡农协会。1951土改成立兴隆乡人民政府。1958年更名为兴隆人民公社。1960年1月，什邡与广汉合县，因重名改为两路口公社。1983年恢复两路口乡人民政府建置。1988年撤乡建镇，集镇位于什邡市城区以北6公里处。镇政府驻地处东经104°12’，北纬31°09’。镇境北连灵杰；南接皂角、元石；西与南泉、云西接壤；东和双盛相邻。境内全是平原，地势由西北向东南倾斜，起伏不大，平均海拔560米，西北端海拔600米，东南端海拔530米。马祖镇属亚热带湿润气候区，平均气温16°，全年日照约1258 马祖镇小时，年降水+查看详细马祖镇概况>>
马祖镇联系电话：0838-8501446
历史沿革：马祖镇旧名两路口、兴隆场。
1950年，建兴隆乡农民协会。
1951年，进行土地改革并成立兴隆乡人民政府。
1958年，兴隆乡改为兴隆人民公社。
1960年1月，什邡县与广汉县合并，因重名兴隆公社更名为两路口公社。
1983年，撤销两路口人民公社，改为两路口乡，恢复人民政府建置。
1988年，撤两路口乡改建两路口镇。
2005年8月17日，两路口镇正式更名为马祖镇。
