因镇政府驻地村名而得名。原为胡苏亭，秦、东魏、唐、金曾为胡苏、临津县城驻地。金太宗天会六年（1128）因水患城毁，县治东迁，此地为保安镇，清朝为包·头店，后称为保店。

宁津县保店镇是驴肉的生产基地，在全国食品评比会上荣获部优产品。近年来，保店镇党委政府非常重视这一历史名优产品，把驴肉作为振兴农村经济重点项目来抓，建立了养殖屠宰、深加工一条龙的生产基地，保店驴肉已注册""保店牌""商标，被国家绿色食品发展中心评为""绿色食品""。 招商政策： 1、凡来保店镇投资办企业，优先安排场地， 2、对投资新上项目，经县验资确认，自投资之日起，投资100万元以上的可免收所得税务2年，500万元以上的，所得税""免二减三""。 3、对来本镇开发建设的，实行特殊保护政策，有工商、税务、公安、司法、电业、邮电等地方职能部门提供全方位服+查看详细保店镇概况>>

保店镇联系电话：0534-5551015

2021年12月，保店镇被认定为第二批山东省乡村振兴示范乡（镇、街）。

2020年12月，山东省农业农村厅公布2020年山东省农业产业强镇名单，保店镇榜上有名。

2020年12月，保店镇入选2020年度山东省省级文明村镇社区名录。

2019年7月，保店镇入选2019年全国农业产业强镇建设名单。

历史沿革：1956年撤区并乡，为保店乡，隶属宁津县。

1958年实行政社合一，成立红旗公社。

1984年政社分开，成立保店镇。

2000年张宅乡并于保店镇至今。