明隆庆版《临江府志》载：相传隆庆六年有马埠市。相传，原南元有巨富名“雷百万”者，养马百匹，在此开设马店，又临沂江，原为重要的船坞码头，且为镇政府驻地，故名。
位于县境东部，与水边镇公路里程10公里，因镇政府驻地马埠墟而得名。东靠桐林，西连水边，东北邻新干县，南与吉水、永丰县为界。全镇总面积162平方公里，辖固山、凰州、芦溪、朱家、马埠、曾安7个村委，总人口12800人。工业有较大发展，有工业企业16个，主要工业产品有胶合板、劳保手套、太阳能热水器等。民营企业宝林胶合板厂为县内规模较大企业之一。全镇耕地面积2389公顷。西瓜为地方特色产品，为有名的“西瓜之乡”。境内交通便捷，省道水（边）流（源）公路穿境而过，距105国道、京九铁路仅9公里、赣粤高速公路29公里。荣誉排行：
2024年3月，马埠镇被江西省爱国卫生运动委员会命名为2023年度江西省卫生乡镇。
2023年10月，上榜江西省2023年省级地名文化遗产名单。
2013年7月，江西省环境保护厅授予马埠镇第六批江西省省级生态乡（镇）荣誉称号。
芦溪桥芦溪桥位于马埠镇芦溪村，清代建筑，东西向，横跨无名小溪，长33米，宽2.9米，高4.02米，跨度5.8米，四墩三孔，整桥基础均为长方形花岗岩错缝砌筑，桥身、桥拱均为青砖砌成，桥墩迎水面均筑成历史沿革：春秋，属吴地，隋属新淦县。
1958年9月，设立马埠公社、1968年，江背并入马埠。
1972年，分马埠，增置上盖、江背公社。
1975年，撤上盖，并入马埠公社。
1995年，撤乡设马埠镇，沿袭至今。
