西汉武帝时期，御史大夫倪宽曾在此读书为官，为民宽厚。倪宽死后，当地人民葬其衣冠于此，今存有“倪谷堆”，“谷堆”即邱。后于此地兴集，故名倪邱集。
倪邱镇地处太和县北部，105国道纵贯南北，黑茨河横穿东西，辖33个村(居)委会，146个自然村，总乡镇人口5.3万人，土地总面积72平方公里，其中耕地面积6.6万宙。主要农产品有小麦、大豆、芝麻、玉米、红芋。倪邱镇粮食市场辐射全国十几个省市，人发制品直接出口欧美，薄荷生产曾被授予“全国簿荷生产状元镇”。荣誉排行：
2018年1月，倪邱镇被确定为第五批安徽省千年古镇。
太和金佛寺太和金佛寺位于太和县倪邱镇东顺河村久安自然村，年代为清代。类别为古建筑。为县级文物保护单位。经锄楼经锄楼位于太和县倪邱镇，年代为清代。类别为古建筑。为县级文物保护单位。倪邱经锄楼倪邱经锄楼位于太和县倪邱镇院内，年代为清，类别为古建筑。倪邱经锄楼为阜阳市市级重点文物保护单位。历史沿革：1952年设倪邱乡。
1969年3月为县辖倪邱人民公社。
1988年8月置倪邱镇，仍属倪邱区。
1992年2月撤销倪邱区，合并倪邱镇、叶堂乡、崔后寨乡设立新的倪邱镇，沿用至今。
