据《叶氏宗谱》载，当地周、徐、叶三大姓有三座台门，故名三门。后因“三”“山”方言谐音，改称山门。

山门镇位于平阳西部，距县城44公里，东接水头镇，西邻晓坑、怀溪乡，南与南雁镇隔溪相望，北界凤卧镇，平（平阳）文（文成）公路横穿而过，全镇面积35.84平方公里，下辖山门、东屿、畴溪三个办事处，有26个行政村，3个居民区，总人口2.87万，是“温州市文明镇”、“温州市生态镇”。2005年全镇共实现工农业总产值14501万元，城镇居民人均可支配收入6138元，农民人均纯收入2823元。 山门是革命老区，素有“浙江延安”之称，早在30年代，山门人民就在曾山、刘英、粟裕等老一辈革命家的领导下开展革命斗争。抗日战争时期，山门是0闽浙边临时省委和闽浙皖赣四省边区主任公署国共合作谈判地，山门大屯村是0+查看详细山门镇概况>>

2023年7月，被评为2023年度温州市“水美乡镇”。

2021年12月，浙江省民政厅认定山门镇为浙江省革命老区乡镇（街道）。

2021年12月，山门镇被命名为2021年浙江省卫生乡镇。

2019年12月，2019年度浙江省美丽乡村示范乡镇名单公布，山门镇榜上有名。

怀溪穹岭景区穹岭古道是位于浙江省平阳县山门镇至文成县巨屿镇的明代森林古道，东南起自怀溪社区水口村、曹门村，西北抵岭边村，始建于明朝末年，因山高岭峻，直指苍穹得名[9-10] 。现存路段以不规则块石铺筑，闽浙边抗日救亡干部学校旧址抗战全面爆发后，全国掀起了抗日救亡运动。为了培养抗日救亡青年干部，中共闽浙边临时省委于1938年1月15日借用原山门畴溪小学校舍，创办抗日救亡干部学校（简称“抗日干校”）。该校对外称“国民革穹岭古道穹岭古道起讫（途经）地点：山门镇水口村经联山村至文成县岭边村。总长度：6公里概况及主要特点：穹岭古道位于平阳县山门镇水口村至文成县岭边村，因山高岭峻，直干苍穹，故名穹岭。当地民间自古便有“穹中国工农红军挺进师纪念园中国工农红军挺进师纪念园位于平阳县山门镇凤岭山，是粟裕率挺进师出发的地方，以“红旗不倒”为主题，“永远的丰碑”为主线，围绕浙南革命根据地和挺进师北上抗日的光辉业绩为核心，结合凤岭山自然风光，中国工农红军挺进师陈列馆中国工农红军挺进师陈列馆位于平阳县山门镇，陈列馆坐北朝南，总面积680平方米。西侧为闽浙边抗日救亡干部学校旧址，西南侧为浙南（平阳）抗日根据地旧址廉政教育基地，东侧为浙江平阳干部学校教学楼。+查看更多山门镇文化旅游景点>>

1930年设山门乡，属北港区。

1949年仍为山门乡，属南雁区。

1956年畴溪、上垟二乡并入山门乡，属山门区。

1958年为山门公社山门大队（管理区）。

1985年改山门镇，属山门区。

1992年东屿、溪源二乡并入。

2011年晓坑、怀溪二乡并入。

2016年晓坑、怀溪社区划出，成立怀溪镇。