因抗日战争年代新四军军部曾设于境内黄花塘，故改名为黄花塘。

黄花塘，原名岗村，境内黄花塘在1943年1月至1945年9月为新四军军部驻地，因此更名。2000年2月全县部分区划调整时，黄花塘乡与新街乡合并设置为黄花塘镇，镇政府驻地为新街。该镇位于县城东南，相距39公里。镇域东部及东南部与安徽省天长市接壤，南部与旧铺镇相连，西部与穆店乡为邻，北部与马坝镇相接，总面积128.8平方公里，属丘陵地区。宁连一级公路，在建的宁淮高速公路、宁徐高速公路穿境而过，区位优势明显。全镇辖16个行政村，2个居委会，224个村民小组，总人口3.3万人。2005年，全镇国内生产总值 亿元，财政收入448.73万元，农民人均纯收入3778元。镇域内矿产资源丰富，其中优质矿泉水极+查看详细黄花塘镇概况>>

2018年3月，江苏省环保厅公布黄花塘镇为首批江苏省生态文明建设示范镇村。

2014年9月，环境保护部授予黄花塘镇2012年—2013年度国家级生态乡镇称号。

黄花塘新四军军部旧址黄花塘新四军军部旧址位于江苏盱眙县城东南，是江苏省重点文物保护单位和爱国主义教育基地。新四军十年战斗的历程里，军部暨0中央华中局在黄花塘谱写了两年又八个月的光辉篇章。在全国抗日战争由相持转入历史沿革：明、清属孝梯乡。

1928年置岗村区，1931年属第九区，1935年分区设署属第一区（城区）。

1936年置岗村乡，1958年属红旗人民公社，1960年析出，以驻地岗村置岗村人民公社，1965年更名为黄花塘人民公社，1968年更名为反修人民公社，1979年复名黄花塘人民公社，1983年改为黄花塘乡，2000年与新街乡合并为黄花塘镇。

2018年，旧铺镇、黄花塘镇、穆镇乡的莲塘村合并，设立新的黄花塘镇。