镇政府驻地清朝时为禁垦围场，光绪末年开发，后逐渐发展成一个屯堡。此地以北两公里处已形成了一个屯堡，叫屯基。人们为了区别这两个屯堡，以流经境内的秀水河为界，北岸的叫北屯基，南岸的叫南屯基。因乡镇政府设在南屯基，故此得名。
东丰县辖镇。1956年置乡，1958年改公社，1983年复置乡，1993年置镇。位于县境中部偏南，距县城7公里，面积71平方公里，人口1.6万。镇政府驻福胜北。东(丰)山(城镇)公路过境。辖南屯基、北屯基、腰堡、北福兴、南福兴、榆林、团林、永兴、万兴9个村委会。乡镇企业有农机修配厂、酿酒厂。农业主产玉米、水稻、豆类。南屯基镇联系电话：0437-6340003
2023年4月，被认定为辽源市2022年度平安乡镇（街道）。
历史沿革：清代为禁垦围场，光绪末年开发，当时此屯叫福胜北。
建国初期，全县分为九区，在五道岗成立第五区政府，为五道岗的忠恕村所辖，属第五区。
1962年，从五道岗划分出来，成立南屯基人民公社。
1983年，撤社改乡，为南屯基乡。
2005年2月，与原红石乡合并，仍为南屯基镇。
