因境内有一户马姓人家在此开大车店而得名。
马家店镇位于东港市中北部，区域面积132.18平方公里，辖14个行政村，有148个村民组，9633户，总人口32006人。镇党委共下设69个党支部，村级党组织有12个党总支，2个党支部，共有党员966名。近年来，镇党委不断加强党的思想政治建设，认真开展“不忘初心、牢记使命”主题教育，扎实推进党史学习教育，教育引导广大党员干部牢固树立“四个意识”，坚定“四个自信”，做到“两个维护”，守初心、担使命、纾民困、解民忧。落实基层党建制度，强化党支部规范化建设，打造村级“一体五中心”，有效提升村级党组织服务能力，提升基层党组织组织力，把全面从严治党落到实处，为全镇经济社会高质量发展提供了+查看详细马家店镇概况>>
后洼遗址时代：新石器时代后洼遗址坐落于东港市马家店镇三家子村后洼屯果园内台地上。后洼遗址出土的石雕龙1981年10月在丹东市文物普查时发现。遗址南北长150米，东西宽100米，总面积15000平方米历史沿革：1961年，马家店公社区域从合隆公社划出，成立马家店公社。
1966年9月，马家店公社改称东风公社。
1970年10月，东风公社恢复马家店公社原称。
1983年8月，马家店公社改乡。
1985年3月，马家店乡改镇。
